MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae HS11286 plasmid pKPHS3

Total Repeats: 240

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016839	A	6	6	48	53	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016839	A	6	6	292	297	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016839	T	6	6	1892	1897	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016839	GTT	2	6	1907	1912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016839	TAT	2	6	1927	1932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016839	AAAGT	2	10	1948	1957	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016839	GGT	2	6	2014	2019	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016839	TGGT	2	8	3884	3891	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016839	AGG	2	6	3894	3899	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016839	AGG	2	6	10304	10309	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016839	GAAG	2	8	10339	10346	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016839	TGGA	2	8	10507	10514	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016839	AAAC	2	8	11088	11095	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_016839	CTTA	2	8	12452	12459	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_016839	TA	3	6	12475	12480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016839	CGG	2	6	12507	12512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_016839	AGTA	2	8	12532	12539	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016839	CGA	2	6	13468	13473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_016839	GAG	2	6	13484	13489	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016839	TC	3	6	14890	14895	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_016839	A	6	6	14931	14936	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016839	TTCA	2	8	14958	14965	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_016839	GGC	2	6	15989	15994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_016839	CTTT	2	8	16003	16010	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_016839	ATG	2	6	16041	16046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016839	GAT	2	6	16109	16114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016839	T	6	6	16356	16361	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016839	AAAG	2	8	16486	16493	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016839	CAT	2	6	17473	17478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_016839	ATG	2	6	17490	17495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016839	CAA	2	6	17505	17510	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_016839	ATTT	2	8	17517	17524	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016839	TTC	2	6	25481	25486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_016839	CCG	2	6	27033	27038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_016839	T	8	8	27047	27054	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016839	CCTCAC	2	12	27351	27362	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_016839	CGC	2	6	27372	27377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_016839	CTC	2	6	27396	27401	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_016839	GGT	2	6	27441	27446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016839	T	8	8	27560	27567	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016839	ATT	2	6	27589	27594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016839	GCTCTG	2	12	27628	27639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_016839	C	6	6	27640	27645	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
44	NC_016839	TAT	2	6	27720	27725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016839	AGG	2	6	27743	27748	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016839	GGT	2	6	27953	27958	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016839	ATC	2	6	27968	27973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_016839	CCTG	2	8	28852	28859	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
49	NC_016839	TAA	2	6	28959	28964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016839	ATA	2	6	29593	29598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016839	AAT	2	6	29723	29728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016839	AT	3	6	30627	30632	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016839	GATT	2	8	30639	30646	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016839	TTTAA	2	10	30659	30668	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016839	ATC	2	6	31548	31553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_016839	A	6	6	31555	31560	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016839	GCCG	2	8	32183	32190	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_016839	GTC	2	6	32587	32592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_016839	TGT	2	6	32691	32696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016839	CGC	2	6	32702	32707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_016839	GCG	2	6	34400	34405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_016839	TCA	2	6	35141	35146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_016839	GAT	2	6	35168	35173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016839	GCTT	2	8	37330	37337	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_016839	GTC	2	6	37341	37346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_016839	CAA	3	9	38645	38653	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_016839	CTG	2	6	38677	38682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_016839	GTT	2	6	38748	38753	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016839	AT	3	6	40094	40099	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016839	TTA	2	6	40119	40124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016839	ATA	2	6	40138	40143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016839	GCC	2	6	40213	40218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_016839	ATG	2	6	41046	41051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016839	GTG	2	6	41365	41370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016839	GCA	2	6	41422	41427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_016839	CTG	2	6	41979	41984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_016839	TGC	2	6	41996	42001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_016839	TGC	2	6	42040	42045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_016839	A	7	7	42072	42078	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016839	GCT	2	6	43253	43258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_016839	TCT	2	6	43294	43299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_016839	GGT	2	6	43315	43320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016839	ATC	2	6	45474	45479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_016839	GAC	2	6	45506	45511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_016839	ACC	2	6	45553	45558	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_016839	CGC	2	6	45567	45572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_016839	TGA	2	6	45577	45582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016839	GCC	2	6	45631	45636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_016839	CTG	2	6	45767	45772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_016839	T	6	6	45799	45804	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016839	TTC	2	6	45858	45863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_016839	CGG	2	6	46338	46343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_016839	AAGG	2	8	46365	46372	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016839	CAG	2	6	49105	49110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_016839	T	8	8	49273	49280	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016839	GCT	2	6	49307	49312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_016839	AGC	2	6	49372	49377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_016839	GTT	2	6	49378	49383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016839	CGG	2	6	49386	49391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_016839	GAA	2	6	49395	49400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016839	TAG	2	6	49411	49416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016839	GAT	2	6	49479	49484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016839	TCC	2	6	49618	49623	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_016839	ATA	2	6	49667	49672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016839	AAT	2	6	49797	49802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016839	AT	3	6	50701	50706	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016839	GATT	2	8	50713	50720	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016839	TTTAA	2	10	50733	50742	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016839	TGA	2	6	52755	52760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016839	TAA	4	12	53622	53633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016839	AGG	2	6	56376	56381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016839	AG	3	6	56389	56394	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016839	AGC	2	6	56704	56709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_016839	CGG	2	6	56734	56739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_016839	GAA	2	6	57426	57431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016839	CCG	2	6	57434	57439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_016839	CCTG	2	8	57459	57466	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
118	NC_016839	TGT	2	6	57643	57648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016839	TTAT	2	8	57685	57692	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016839	ATT	2	6	57694	57699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016839	CAT	2	6	57704	57709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_016839	ATA	2	6	57713	57718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016839	ACT	2	6	58374	58379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_016839	A	6	6	58388	58393	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016839	G	6	6	58399	58404	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016839	G	6	6	61423	61428	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016839	GAT	2	6	61476	61481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016839	TGG	2	6	61484	61489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016839	TGTA	2	8	61549	61556	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016839	CAT	2	6	61830	61835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_016839	GTG	2	6	61847	61852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016839	TCT	2	6	63396	63401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_016839	TCC	2	6	63436	63441	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_016839	AAAC	2	8	63476	63483	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_016839	TTA	2	6	63501	63506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_016839	CTG	2	6	63528	63533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_016839	CCT	2	6	64281	64286	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_016839	CCT	2	6	66421	66426	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_016839	T	7	7	66857	66863	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016839	GGC	2	6	67378	67383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_016839	A	7	7	72818	72824	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_016839	TTA	2	6	72902	72907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_016839	G	8	8	72963	72970	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
144	NC_016839	TTAAAG	2	12	73019	73030	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
145	NC_016839	AG	3	6	73029	73034	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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156	NC_016839	TAAA	2	8	74782	74789	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.